中醫眼科所能處理的問題很廣，從眼睛最前面到最後面都有，例如：
眼瞼緣炎、結膜炎、乾眼症、角膜炎、角膜反覆性破皮、角膜潰瘍、虹彩炎、葡萄膜炎、飛蚊症、玻璃體出血、黃斑積水、黃斑出血、黃斑退化、視網膜退化、視網膜失養、視神經萎縮、青光眼、早期白內障等問題，都有不錯的治療效果。
中醫眼科與西醫眼科比較，當然各有所長。舉例來說，西醫眼科治療乾眼症，以點人工淚液為主，只能暫時舒緩，無法離開頻頻點藥的麻煩，中醫眼科卻可以治癒；反之，白內障早期，中醫眼科可以防止其進行，但白內障的後期，就不如西醫眼科，應該選擇西醫眼科的開刀摘除。
基於此，中西醫眼科應該合作，或選擇學貫中西醫眼科的專科醫師，較為理想。